Wie gesagt: Beim Treiber könnte ich mir noch vorstellen, dass es mit der Code-Änderung zum Fokus-Setzen auf das Treiber-Fenster zu tun hat. Das schaue ich mir bei Gelegenheit auch mal an aber ansonsten habe ich keine Ahnung, warum der Wechsel vom minimierten Zustand in den Normalmodus manchmal bei Dir damit einhergeht, dass das Fenster nicht im Vordergrund ist.
Bei mir ist es in dem Moment immer im Vordergrund und ich habe das ehrlich gesagt auch noch nie anders gesehen. Mir passiert es aber ab und zu, dass ich z.B. das Outlook-Icon per Doppelclick nach oben holen will und aus Versehen aus dem Doppelklick ein "Doppel+1"-Klick wird und dadurch der Fokus tatsächlich auch manchmal wieder auf dem Desktop ist.
Den Sync können wir aber denke ich insofen ausschliesen, als dass Du ja schreibst, das Problem war auch schon vor dem Update mit dem Sync-Status-Umbau vorhanden?!