Das erscheint mir nicht nur richtig und logisch zu sein, es geht ja auch garnicht anders.
Die Messergebnisse BEIDER Systeme unterligen Schwankungen, die sich in so einem Diagramm als "Gezapple" bemerkbar machen. Überall in der Technik werden unerwünschte Schwingungen gefiltert. Wollte ich die Schwankungen des Messsystems messen, müsste ich die Veränderungen des Verlaufs herausfiltern. Will ich den Verlauf vernünftig erfassen, filtere ich das "Gezapple" heraus. Wie das geht, kann man z.B. bei Hochpass- bzw. Tiefpassfiltern nachlesen.
Ich kann also nie die beiden UNGEFILTERTEN Profile genau miteinander vergleichen, weil sich die Unsicherheiten u.U. zusammen aufrechnen. So ist ein direkter Vergleich einzelner Messwerte verschiedener Systeme nie so genau wie die einzelnen Systeme selbst. Nur mit Filtern kann man zufällige Maßabweichungen vermindern.